浮游植物是指水環(huán)境中以浮游狀況生計的植物，多指水體中的藻類植物。藻類在水體中過度繁衍，會出現(xiàn)水華現(xiàn)象，也就是水體富營養(yǎng)化。近年來，生活污水含磷量大起伏提升，促使以磷為營養(yǎng)物質(zhì)的藻類植物很多生長，遮蓋水面，爭奪水體中的溶解氧，影響陽光的射入，導(dǎo)致水體中的植物、動物生計環(huán)境惡化。因此，藻類植物成為生物監(jiān)測范疇重要的指示生物。不同品種的藻類植物對不同污染物的反響有較大的差異，監(jiān)測人員可以經(jīng)過藻類的豐度、細(xì)胞密度、光合效果強度來進(jìn)行判別。例如，石莼是一種重金屬承受才能較高的藻類植物，可以有用富集水體中的重金屬，被稱為重金屬污染的“哨兵”。小球藻是一種對苯并芘十分靈敏的藻類植物，苯并芘在小球藻中聚集，人們可以經(jīng)過熒光顯微鏡進(jìn)行觀測和定位，這對于斷定船只漏油、工業(yè)廢水排放影響范圍有較高的指示效果。

浮游動物主要包含無脊椎動物和脊椎動物的幼體，它們沒有主動游水的才能，只能隨著水波漂動。在自然水體中，浮游動物的散布非常廣泛，對水體中污染物的影響也十分靈敏，且作為魚類生物的捕食目標(biāo)，也可以間接反映魚類生物種群的一些改變，因此，浮游動物在生物監(jiān)測范疇內(nèi)發(fā)揮著重要效果。刺胞動物是一種接觸重金屬等污染物后會出現(xiàn)細(xì)胞體積改變的浮游動物，可以作為水體中重金屬等污染物的指示生物。橈足類湯氏紡錘水蚤卵是脊椎動物的幼體，常用于量化硫化物等污染物的生物毒性，這種水蚤的繁衍才能、種群數(shù)量、死亡率都可以用于檢測急性、緩慢有毒污染物的生物毒性，如農(nóng)藥污染。